重慶三峽醫藥高等專科學校是教育部批準，重慶市人民政府舉辦，重慶市教委主管的普通高等學校，是三峽庫區唯一獨立設置的全日制醫藥衛生類高等院校，是重慶市市級示范性高等職業院校，重慶市優質高等職業院校，國家優質專科高等職業院校，國家高水平專業群建設單位。學校在GDI智庫高職高專排行TOP1000榜中，2021年全國高職高專排名第55。

重慶市萬縣衛生學校創建于1951年，重慶市萬縣中醫藥學校創建于1974年。2006年，兩所中職院校合并升格設立重慶三峽醫藥高等專科學校。2009年，學校管理體制由萬州區管理調整為重慶市教委管理，通過教育部高等職業院校人才培養工作合格評估。2010年，學校被確定為重慶市市級示范性高等職業院校建設單位。2017年，學校成為重慶市優質院校。2019年，學校通過教育部現代學徒制第二批試點單位驗收，被確定為國家優質專科高等職業院校、中國特色高水平專業群建設單位。

學校坐落在萬川畢匯的三峽庫區腹心—重慶市萬州區，歷經70余年櫛風沐雨，秉持“學則恒心，醫則仁心”的校訓，堅守“質量立校、特色強校、改革創新、開放辦學”的辦學理念，恪守“立足三峽、輻射西部、統籌城鄉、服務基層”的辦學定位，逐步形成了“學惟真、行惟實、醫惟仁”的校風、“引導向學之心，升華向善之志”的教風、“勤學、力行、誠信、擔當”的學風，努力把學校建設成為優勢突出、特色鮮明、國內知名的一流醫藥高等職業院校。

學校占地面積2071畝，校舍69.4萬平方米（含在建校舍25余萬平方米），擁有圖書320萬冊，固定資產總值20億元，教學科研儀器設備總值保持年遞增10%以上，基礎設施建設穩步推進，發展后勁不斷增強。學校有直屬附屬醫院3家，開放病床2000余張，非直屬附屬醫院8所，教學醫院10所。